ellhan大，您這樣回答好像有點文不對題，而且重點沒回答。
簡單回答就像antijava大這樣，或是「ActionScript 3」。
發問者想要知道的只是用什麼語言開發，使用C#能不能做到。

詳細回答的話：

1. 在網頁中跑的是swf格式的檔案，不論使用flash或是flex，最後是產出這個檔案
2. 瀏覽器依賴flash player來播放這個格式的檔案，在不同作業系統及平台上可能會有不同版本的flash player plugin，但是他們基本上可以用來播放同樣的swf格式檔案。這些flash player裡面是有內建一個vm（avm）用來執行編譯好的byte code，這些byte code應該是跨平台的。理論上只會有版本的不同而不會有平台的不同。（甚至也有open source的player，但是相容性不好，還沒趕上新規格）
3. 要跑c#也不是不可能，但是絕對不會支援.net framework裡面的東西，而是依賴flash/flex的library，而且最後需要把C#程式編譯成avm可以執行的byte code然後內嵌到swf檔案中。就看有沒有人這樣搞。
4. swf格式是公開標準，可以到adobe網站下載規格書。

Flex是Adobe公司所發展用來開發「RIA(Rich Internet Application)」的工具，「RIA」(詳維基網站或第2期電子報介紹)簡單的說就是在Internet上面執行的高親和性操作介面的應用程式。

應用程式的發展大致可以簡單區分為4個階段：

DOS應用程式：文字操作介面。

Window應用程式：
優點：(a). 圖形化操作介面，使用者容易操作。
(b). 程式容易開發，開發工具有：VB、Delphi、PowerBuilder…。

缺點：(a). 版本控制不易，新版本通常必須更新到使用者的電腦上。
(b). 跨平台困難，同一份程式無法在不同類型的作業系統上面執行。
(c). 一般應用在區域網路上。

Web應用程式：
優點：(a). 版本控制容易，使用者的電腦上只需要安裝瀏覽器。
(b). 應用在Internet上。
缺點：(a). 雖然是圖形操作介面，但是受限於瀏覽器的功能，操作介面的親和性普遍不
高。
(b). 缺乏好用的開發工具。

RIA：結合Window和Web應用程式的優點。
這樣的發展趨勢在類似Flex這樣的開發工具出現之後，應該會變的更快速，可以預見在不久的將來，Internet上的應用程式都會有更好用的操作介面。

基本上Flex提供了滿足這些需求的條件，主要原因是它具備下面這些特性：

豐富的視覺化元件：RIA的特性之一就是操作介面的親和性，這也是Web應用程式最大的問題，這些元件是構成操作介面的基本元素。Flex應用程式和Web應用程式不同的地方是：Web應用程式將原始碼傳送到Client的瀏覽器執行，所以操作介面受限於瀏覽器的功能，Flex應用程式則是將編譯過的程式碼送到Client端的Flash執行，操作介面可以有更大的彈性。

OO的特性：利用物件的封裝和繼承，可以一步一步建構發展系統所需要的元件，便於快速開發穩定的大型系統。
在軟體開發模式中，有一個80/20法則，就是用20%的時間去開發系統80%的程式，再用80%的時間，去完成剩下的20%，這是因為我們很容易找出大多數系統共同的部分，將這些共同部分包裝成元件，並且套用到80%的程式，而不能套用的部分通常是包含特殊的規則或是操作流程，這部分會需要比較多的時間來討論、修改和撰寫。要實現這個80/20法則，依賴的就是這個OO的特性。

除錯和編譯。

跨平台：Flex使用Flash做為Client端的Virtual Machine來跟Flex應用程式溝通，每個平台有自己版本的Flash，藉此達到跨平台的目的。

簡單回答：不行

Flex 跟 C# 不是同一個系統。

但是 SilverLight 可以用 C# 喔，還很強大喔。

看這個範例，在這個網頁就可以寫 APP.

http://www.microsoft.com/silverlight/silverlight/demos/OOB/default.html

Flex的對手是Silverlight
Flex 是以MXML+ActionScript3 組成程式碼
Silvelight，XAML+VB或C# 組成，因為是微軟派，所以可以用.NET語言寫，是很自然的事。
另外，Adobe為使程式開發涵蓋範圍擴大，大幅改進ActionScript3，其物件完整度已不可同日而語。
Flex與Silverlight的意義在更容易的創造出豐富的介面，不論是在Web或Clien AP上
因此各自隸屬不同派別系統(Adobe、Microsoft)，Flex如果要與其他語言寫成的程式溝通，Adobe文件提到Web Service及Flash RemoteObject為主，不限定是哪種語言，個人目前都是透過Web Service 或 TCP Socket較多。
至於說哪個強哪個好，聽聽就好，目前各有支持，爭議頗高，尚無定論。
目前一路用下來，感覺最大的差異在於，Adobe知識文件豐富及完整程度，實在不如微軟。中文文件更不用說，如果只靠官方文件或網站，會有點辛苦。

主要就是, 若是要和 [微軟] 產品相結合的話, 在 [ FLEX ] 和 [ Silverlight ] 選擇上又沒有預設立場的話, 就可以直接選擇 [ Silverlight ] 了. (相信這樣的情況, 應該適用很多人了~)

開發Flex是用ActionScript 3 + MXML(XML標籤)
補充:MXML每個標籤背後都是由ActionScript 3的class組成，所以學好Flash/Flex來說，ActionScript 3是一件很重要的事。

另外Flex SDK是OpenSource，也就是SDK不用錢，但Flex Builder開發工具要$$，意味你可以自己改寫SDK，也可以直接用notepad直接開發Flash/Flex程式，再直接編譯，就要看你的用意。

Flex再簡單來說就是開發Flash應用程式的好工具，拿C++、C#或其他語言來跟Flex比，有點是牛頭不對馬嘴，都不是重點，重點是你要開發什麼應用，用在哪裡，適得其所才是關鍵。

對於學習者而言，學好ActionScript 3，要開發Flash / Flex應用程式就不會是難事，再擴大範圍講，你有OO物件導向基礎，學什麼都會快，C#、Java也一樣。

10幾年前我的心靈導師兼好兄弟與我分享，在開發這條路上，若你要成為所謂開發的Guru級人物，工具->語言->系統->平台，四大階段與進程，就看你的規劃與用心，跟你現在走到哪了？

不管你能力多好，多有才幹，但多數人都會忽略一個更重要的事，就是個人品德與謙卑態度，才是會令人尊敬與激賞。

願與大家共勉！

註：因看到大家討論Flex / RIA此議題有感而發，但本篇討論本人不會再回覆，有任何問題可以到RiS平台找到我 http://forum.j2eemx.com

Thanks a lot.