第一：Javascript Tag不能這樣巢狀使用。

第二：請盡量不要使用document.write，除非你很清楚你在做什麼。用php來產生前端的code還比較不會出問題...

第三：如果是要繪圖的話，取一個值就要去資料庫撈一次，這種做法太花時間了。建議每次要把所有資料一次讀出再畫出。

從你目前的邏輯看起來，你要跟資料庫撈資料的條件是從一個n到m的連續整數，所以只要傳n跟m給php，叫他把所有資料一次吐給你就好了。這樣用jsonp來處理也很方便。例如你可以這樣做：

php端（例如叫做test.php）：

<pre class="c" name="code">
<?php
$n = mysql_real_escape_string($_GET['n']);
$m = mysql_real_escape_string($_GET['m']);
$link = mysql_connect("127.0.0.1", "帳號", "密碼") or die("糟糕！無法連上資料庫喔！" . mysql_error());
$sql="select * from m where Seq>=$n AND Seq<=$m";
mysql_select_db("DATABASE");
$result=mysql_query($sql,$link);
//mysql_db_query will be deprecated in php 5.3.0, so...don't use it
$Vgs = array();
while($data=mysql_fetch_array($result)) {
  $Vgs[] = $data['V'];
}
if (count($Vgs)==0)
  $Vgs[0] = 0;
header("Content-Type: text/javascript");
//change to "application/json-p" in the future...
echo 'updateData(['.implode(',', $Vgs).']);';
?>

javascript部分：

<pre class="c" name="code">
<?php
//定義$Seqg的數值
?>
<script type="text/javascript">
// we use an inline data source in the example, usually data would
// be fetched from a server
var data = [], totalPoints = 300, n=<?php echo $Seqg; ?>;
function getRandomData() {
	if (data.length > 0)
		data = data.slice(1);
	// do a random walk
	var m = n;
	while ( data.length < totalPoints ) {
		if ( data.length !== 0)
			n++;
	}
	var scrpt = document.createElement('script');
	scrpt.src = 'test.php?n='+m+'&m='+n;
	document.getElementsByTagName('head')[0].appendChild(scrpt);
	document.getElementsByTagName('head')[0].removeChild(scrpt);
	scrpt = null;
	//return res;
}
function updateData(ary) {
	// zip the generated y values with the x values
	var res = [], i=0;
	
	for(i=0; i<ary.length; i++) {
		data = data.concat(ary);
	}
	for (i=0; i < data.length; i++)
		res.push([i, data[i]]);
	//剩下Code為繪圖且定時更新的部分...
}
</script>

大致上是根據你的邏輯改的，但是我也可能猜錯你的邏輯就是了。另外，我沒實際跑過，有錯誤的話請多見諒。