用錨點a id 可以做到這件事情，如下面程式碼範例

index是主頁包含兩個iframe，
第一個iframe是iframe1
第二個iframe是iframe2

點選iframe1中的連結
會讓iframe2跳轉到指定地方

index.html

<iframe src="iframe1.html"  width="100%" height="20%" name="top"></iframe>
<iframe src="iframe2.html"  width="100%" height="80%" name="center"></iframe>

iframe1.html

我是上面
<ul>
	<li><a href="iframe2.html#first" target="center">link1</a></li>
	<li><a href="iframe2.html#second" target="center">link2</a></li>
	<li><a href="iframe2.html#third" target="center">link3</a></li>
</ul>

iframe2.html

<style>
#firstDiv{
	position: absolute;
	top:100px;
	background-color: red;
}
#secondDiv{
	position: absolute;
	top:500px;
	background-color: blue;
}
#thirdDiv{
	position: absolute;
	top:2000px;
	background-color: yellow;
}
</style>
我是中間
<div id="firstDiv">
	<a id="first">
	第一塊區域
	</a>
</div>

<div id="secondDiv">
	<a id="second">
	第二塊區域
	</a>
</div>

<div id="thirdDiv">
	<a id="third">
	第三塊區域
	</a>
</div>