iT邦幫忙

鐵人檔案

第 11 屆 iT 邦幫忙鐵人賽
回列表
自我挑戰組

猶豫就會敗北,果斷就會白給|園藝 boy 的生物資訊冒險記趣,跟上學術潮流不走冤望路 feat. RNA-Sick 系列

給生物出身同學的生物資訊入門小指南,搭配各種數位工作術小技巧,讓我們的學術之路更順遂~

鐵人鍊成 | 共 30 篇文章 | 9 人訂閱 訂閱系列文 RSS系列文
DAY 1

RNA-Sick@Day1 > 你己被選中成為「賽博格研究生」|生物資訊 の 冒險記趣 feat. Phylo

最新版本請見:https://chenhsieh.com/post/bioinfo/01-cyborg-and-bioinfo/ 想寫點生物資訊的東西,為什麼要...

DAY 2

RNA-Sick@Day2 > 一旦接受了這種設定,操作起電腦還是挺帶感的嘛|像個駭客一樣用電腦 feat. Terminal (終端機)

最新版本請見:https://chenhsieh.com/post/bioinfo/02-terminal-usage/ 喜歡打字嗎?那你先不要用滑鼠 有一個關...

DAY 3

RNA-Sick@Day3 > 小孩子才要做選擇,我全都要|入門生物資訊該學什麼語言呢 feat. Anaconda

最新版本請見:https://chenhsieh.com/post/bioinfo/03-anaconda/ 勇者您好,請選擇初始職業與裝備 這篇繼續進行啟程前...

DAY 4

RNA-Sick@Day4 > 我們凡事求一個圓|第一次執行 Python 腳本就來算圓周率吧 feat. Jupyter Notebook

最新版本請見:https://chenhsieh.com/post/bioinfo/04-python/ 在夏末的傍晚,突然想用電腦算個圓周率 說算就算,原理...

DAY 5

RNA-Sick@Day5 > 原來是純文字編輯器啊,我還以為是整合式開發環境呢|準備一個喜歡的打字所在 feat. Atom

最新版本請見:https://chenhsieh.com/post/bioinfo/05-text-editor/ 英雄需要披風,搞資訊的人需要一個自己喜歡的純...

DAY 6

RNA-Sick@Day6 > 我相信自由自在,我詳細希望|下載 NCBI 上的原始序列 feat. SRA Toolkit (上)

最新版本請見:https://chenhsieh.com/post/bioinfo/06-sra-1/ 每次追動畫最不想看到的就是混時間的總集篇 但是該省的經費...

DAY 7

RNA-Sick@Day7 > 我相信自由自在,我詳細希望|下載 NCBI 上的原始序列 feat. SRA Toolkit (下)

最新版本請見:https://chenhsieh.com/post/bioinfo/07-sra-2/ 找尋香蕉抗病秘方之前情提要 為了讓農民更開心、健康地生產...

DAY 8

RNA-Sick@Day8 > Raw Data 是什麼,能吃嗎?| 一鍵了解序列品質 feat. FastQC

最新版本請見:https://chenhsieh.com/post/bioinfo/08-fastqc/ 進入轉錄體流程篇 已經寫完了奠定基礎功的七篇,第八天開...

DAY 9

RNA-Sick@Day9 > 斷開序列,斷開一切的牽連|把品質不佳的序列剔除掉 feat. Trimmomatic

最新版本請見:https://chenhsieh.com/post/bioinfo/09-trimmomatic/ 自動修剪機,修鹼基 fastq 檔案中存放的...

DAY 10

RNA-Sick@Day10 > 我來組成頭部|把短片段序列組裝成轉錄體 feat. Trinity

最新版本請見:https://chenhsieh.com/post/bioinfo/10-trinity/ 神奇的轉錄體拼圖 透過 RNA-Seq 進行轉錄體分...