鐵人檔案
給生物出身同學的生物資訊入門小指南，搭配各種數位工作術小技巧，讓我們的學術之路更順遂～
最新版本請見：https://chenhsieh.com/post/bioinfo/11-trinotate/ 代號之卷 (Component, Gene, I...
最新版本請見：https://chenhsieh.com/post/bioinfo/12-bowtie2/ 燕尾服套裝軟體取名的惡趣味總讓我想到黑暗大法師 RN...
最新版本請見：https://chenhsieh.com/post/bioinfo/12-kallisto/ 放棄比對的話，新世界的大門就開啟囉 想知道手邊的兩...
超級比一比之 CPM, FPKM, TPM RNA-Seq 的主要目的之一就是找到試驗設計處理組間的差異表現基因 (Differential Expressio...
轉錄體流程篇回顧 經歷了基礎篇與轉錄體流程篇的洗禮，想必各位讀者也已經從被趕上架的鴨子編成獨當一面的烤鴨了，來回味一下整個轉錄體流程的概況吧！ RNA-Sick...
綜合分析篇來囉 『園藝 boy 的生物資訊冒險記趣，跟上學術潮流不走冤望路』系列共有四部分：「基礎篇」、「轉錄體流程篇」、「綜合分析篇」、以及「學術生活篇」。「...
富集分析三步驟 上一篇中已經簡單地說明基因本體論富集分析的概念，這次就來實際操作吧！ (截圖來自 Caterpillarplasty) 在開始之前補充一下，從基...
詞彙列表的視覺化 基因本體論富集分析，由基因名稱列表濃縮成人類可以理解的詞彙，可以說是一種轉化的過程。 但是這個結果還可以進一步濃縮，由詞彙與輸出數值的表格再...
需要將基因分群的場景 試驗設計有兩個組別以上的話，就會有超過一組的處理比較組。比如說香蕉由綠轉黃的過程就可以分成很多階段，取其中的四個階段採樣，同一轉錄產物在...
社交惡夢之請跟你座位旁的同學一組 k-means clustering 是我覺得最直觀好理解的分群方式。完整分群的過程概念可以分成兩大部分： 一是計算資料點之間...
