如果先不談傳輸速度...最大的差別在於擴充性..
SAS 介面的Disk Array ..雙控制器最多也只有4個連接到主機端的Port...也就是說最多接到4台主機
Fiber 介面的Disk Array雖然雙控最多也是4個連接到主機端的Port..但日後可以透過Fiber Switch(此Fiber Switch跑的是SCSI的協定,不是TCP/IP)連接主機,透過Fiber Switch...只要Port數夠,要加主機或加Disk Array都可以,也就是主機和儲存設備的數量擴充比較有彈性,這個就是一般在講的SAN(Storage Area Network)
價格方面(如果是4台主機以內的架構)...FC to SAS 比SAS to SAS價格貴一些,FC HBA 也比SAS HBA貴一些..但數量不多的話是不會差多少..
FC Switch 大都十萬以上(最便宜的8 Port也要大概九萬上下)..這是在SAN的架構下需要加的...
現在FC Switch 已經開始有8Gb/s的介面出現了, 不過Disk Array還沒跟上...但就未來性而言..FC 介面看起來會比較快一些

這一篇文章有很詳細的說明
http://www.ithome.com.tw/itadm/article.php?c=44614&s=1

在第三頁有關於不同介面的介紹

<pre class="c" name="code">SAS磁碟陣列的三種類型
SAS磁碟陣列的定義在於「由SAS硬碟組成的磁碟陣列」，也就是說陣列內部使用SAS硬碟，但基於應用環境的不同，磁碟陣列對外的介面可以有SAS、FC與iSCSI等三類，也就是SAS-SAS、FC-SAS與iSCSI-SAS等三種SAS磁碟陣列。

其中SAS-SAS是用於直接連接伺服器的DAS環境，使用者只要在主機上安裝SAS HBA即能連接SAS磁碟陣列。目前SAS HBA價格並不比SCSI高多少，如我們這次借測的LSI Logic SAS3442X市價大約300多美元，另一款較高階含8埠的Adaptec SAS 58300則約1,200～1,500美元，相較下普通的FC HBA市價即在1000美元以上。

不過SAS雖然頻寬更高，但因連接距離不長，對大型儲存網路來說還是得用長距離連接能力更好的FC介面，此時即可透過控制器轉接FC埠，讓SAS磁碟陣列能接上FC SAN，也就是FC-SAS。

但考慮到FC SAN牽涉到的交換機與HBA等元件均相當昂貴，因此部分用戶傾向使用以IP網路為基礎的iSCSI SAN。但在使用iSCSI的同時若又想擁有較佳的磁碟存取性能，此時即可選用內部使用SAS硬碟的iSCSI-SAS磁碟陣列。