根據小弟的淺薄經驗，給樓主以下建議
1.fortigate能不能排程 讓他自動關機?
答案是可以的，用另外主機排程給Fortigate下關機指令
不過，如果知道確切時間的話，何不直接連線做關機?

2.fortigate復電後會自動開機嗎?
不會自動開機，除非當初斷電時電源開關沒有關閉
但這樣做也有通電時電脈衝突波的風險，機器容易故障

3.三台server在有UPS的情況下 復電後就會重啟了?
應該是不會，要重啟Server有相關配合的條件，包括主機能不能支援

特別提醒樓主，
Fortigate需要正常關機
Fortigate需要正常關機
Fortigate需要正常關機
因為很重要所以說三次
尤其是現在的版本一定需要正常關機
如果不正常關機系統會一再提醒您
上次重啓是由電源中斷觸發的, 系統已啟動並運行，但 log 硬碟可能有問題。強烈建議您在繼續之前檢查檔案系統的一致性。
因為現在的系統小弟研判有一部分在DISK中
長時間忽略此狀況可能最嚴重導致硬體毀損
建議樓主特別注意此狀況

不熟的情況下最好是到場處理，工務單位能幫忙的就是電源按下去，但有沒有問題就不知道了..
關機不想到現場又沒辦法自動化的情況下就是遠端連入處理
UPS的部分可以參考前輩的討論https://ithelp.ithome.com.tw/questions/10053556

正常來說，ups本身就可以做自動開關機的動作才對。
當然也是得看ups能支援不支援。

曾經在某公司，有用過一台大型的ups。負責供應2台server跟路由處理。
其可以透過網路線做控制設定。能設定當沒市電時，幾分後自行關機。有市電時幾分後自動開機。
該台ups可供應約1~2小時的電源。(其實也沒實際測試最大時間)
所以一般都是設定1個小時後自動關機。

不過一般還是盡量不要靠自動就能解決。最好還是要有人留守處理會比較安全

以前在前東家的作法是
Server設定排程關閉
網路設備手動關閉
復電時還是會一個一個檢查有沒有正常啟動

基本上還是人到場作業比較能在當場排除突發情況，尤其是老舊機房意想不到的情況仍然是有機會發生的。