我不知道你是否了解所謂的「bb code」的應用。就先當你不了解。

所謂bbcode的應用。就是文章內容內有特殊的字段。會自動轉義成另一種模式。
如

[url=http://xxx.xxx.xxx]

在輸出到頁面會轉譯成

<a href=http://xxx.xxx.xxx>http://xxx.xxx.xxx</a>

在了解以上的情況。其實你的問題就大致上可以解決了。
大多數而言，關鍵字搜尋我還會搭配全文索引的模式來做定義處理。這是另外一門學問，我就先不教了。

一般來說，我會用如下的程式碼處理。

<?php
$getData = (從資料庫取出資料);
foreach($getData AS $_d){
    $s[] = $_d['key'];  //準備要比對的key
    $c[] = '<span class="txtkey">'.$_d['data'].'</span>'; //準備要轉換的內容
}
$txt = (取得內容);
str_replace($s,$c,$txt);

也就是說，將關鍵詞取出後做取代成我要的東西。一般來說，我會直接包span。方便處理css跟連結控制。

為了好維護以及效能考量，不太建議在輸出結果時做這樣事情。我反而建議在資料庫設計跟程式都要考慮：

1. 在table中設計兩個欄位，一個放你輸入的內容，一個放處理過的內容。頁面讀取的都是處理過的內容，除非內容沒東西。
2. 在輸入後，先存進資料庫，然後用一個非同步的程序跑搜索跟輸入文字的處理（直接把關鍵字加上html tag或是加上bbcode之類）
3. 如果有需要另外寫一個批次處理的程式，把資料庫裡面的東西一次處理。如果新增了字彙，你就會需要這樣做。

這樣做的理由：

1. 比較不影響輸入資料的順暢，不用等程式處理完才知道東西有存進去系統
2. 容易進行內容更新，只要針對輸入做處理，不需要管各種tag怎麼去parsing
3. 安全：自己可以在頁面輸入bbcode、甚至html tag是一件很比較危險的事情。只允許輸入無任何標記的文字，然後用程式處理會比較安全。