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我們的基因體時代-AI, Data和生物資訊 Overview

大家好,我們的基因體時代是我之前一直在經營的部落格名稱,假如對於生物資訊、合成生物學、基因體學、資料視覺化、R有興趣的話,可以來參觀參觀,也歡迎同好多多交流,這次來報名2021年的鐵人賽,想挑戰一下來撰寫生物資訊中關於AI和Data的角度,應該會頗有趣且深具挑戰,let's writing to learn!

起手式,先來架構一下,這個月的計畫,然後相關的閱讀參考

第一週:2021/9/01 - 2021/9/05(5天)

  • Knowledge-這一週先以大範圍的介紹機器學習在基因體學中的角色、大數據在生醫領域、合成生物學中的生物資訊

第二週:2021/9/06 - 2021/9/12(7天)

  • Data-分子生物學、基因體學中的資料格式

第三週:2021/9/13 - 2021/9/19(7天)

  • Tools-介紹Bioconductor和其ecosystem的工具和資料結構

第四週:2021/9/21 - 2021/9/26(7天)

  • Advance topis in AI using in life science

第五週:2021/9/27 - 2021/9/30(4天)

  • let's tackle COVID-19 with AI and Data

重要的點

  • Tools used in Molecular Biology: Benchling, Snapgene
  • Synthetic biology design tools
  • Bioconductor
  • Tidyverse
  • NIH API, Unix tools
  • Biopython
  • GATK
  • Common workflow Langugage
  • Cloud tools
  • 台灣超級電腦

學習參考:
Resources

Talks


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