Biobank

簡介羅列一些我們這個領域常見會聽到的
NCBI、UCSC、Ensembl、UK biobank、gnomAD、COSMIC、Varsome dbSNP

1. NCBI（National Center for Biotechnology Information）：
- NCBI是美國國立生物技術信息中心，成立於1988年，是NIH的NLM的一個分支機構。
- NCBI的主要目標是提供在線的生物學數據和生物信息學分析工具，以幫助研究人員更好地理解生物學問題。
- NCBI管理著多個生物信息學數據庫，包括PubMed、PubMed Central、GenBank等。

2. UCSC（University of California, Santa Cruz）：
   • UCSC Genome Browser是由加州大學聖克魯茲分校開發的在線基因組瀏覽器。
   • 這個瀏覽器允許研究人員查看和分析多種生物物種的基因組數據，包括基因定位、序列注釋和相互作用。
   • UCSC Genome Browser提供了強大的數據檢索和可視化工具。

3. Ensembl：
   • Ensembl是由歐洲生物信息學研究所（EMBL-EBI）和英國Sanger研究所共同開發的基因組註釋項目。
   • 它提供了多種生物物種的基因組數據，並注釋了基因、蛋白質、轉錄本等信息。
   • Ensembl還提供了多種工具，如BLAST、BioMart和Variant Effect Predictor（VEP）。

4. UK biobank：
   • UK Biobank是一個大型、長期的生物醫學研究計劃，在2006至2010年間，UK生物庫從英國各地招募了50萬名的志願者，收集了大約1500萬份血液、尿液和唾液的生物樣本，並對所有參與者進行了基因分型和血液生化分析，並長期追蹤他們的健康和醫療狀況資訊。同時資料庫收集所有研究成果，並提供給其他研究人員。
   • 研究人員可以使用UK Biobank的數據來探討多種健康問題，如心血管疾病、癌症、遺傳因素、生活方式影響等，以改進公共健康和醫療實踐

5. gnomAD（Genome Aggregation Database）：
   • gnomAD是一個包含大規模人類基因組數據的數據庫，旨在研究基因組中的變異和多態性。
   • 它匯總了來自不同人口的數千個個體的基因組數據，包括SNP和INDEL。
   • gnomAD的數據可用於研究罕見變異和基因突變。

6. COSMIC（Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer）：
   • COSMIC是一個關於癌症的數據庫，收集了癌症中的體細胞突變信息。
   • 它包含了多種癌症類型的基因突變數據，並提供了相關的注釋和統計信息。
   • COSMIC的數據有助於癌症研究和臨床診斷。

Bear的小murmur

今天寫累了www 剩下的明天補上....
這裏面其實每個網站，要講可以多講一點，但我怕篇幅太長，想說簡單介紹一下就好，裡面的一些工具，也許有用到再自己慢慢來查~~