我之前是這樣搬家的(Server 2000 搬資料到 Server 2003)，提供給您參考：

兩台都已經加 Domain，Server 2003 安裝 Robocopy 搬資料，搬完開共享 & 檢查權限，改 User 的 Logon Script 連線到 Server 2003。

在 Server2003 安裝微軟官方的工具：Robocopy

Server2003 要自己下載 → Windows Server 2003 Resource Kit Tools 才有 Robocopy 這個工具。

載點在這邊：http://www.microsoft.com/Downloads/details.aspx?FamilyID=9d467a69-57ff-4ae7-96ee-b18c4790cffd&displaylang=en

Robocopy.exe: Robust File Copy Utility <--- 安裝完就會有這個小工具。

接下來，就是執行同步~

1.開始→控制台→排定的工作
2.滑鼠右鍵→新增排定工作
3.新工作→滑鼠右鍵→選內容→在執行的地方貼上下列語法。

"C:\Program Files\Windows Resource Kits\Tools\robocopy.exe" "\\192.168.1.5\D$\RDFile (備份來源路徑) " "\\192.168.1.7\D$\RDFile (備份目的地路徑)" /r:5 /w:10 /v /copyall /mir /LOG+:C:\RoboCopyLog\LOG檔名.txt

/R:n 複製失敗重試次數
/W:n 兩個重試的等待時間
/V 顯示詳細的複製結果，會標示New Extra Skip
/copyall 複製檔案所有屬性，就是D=資料，A=屬性，T=時間戳記，S=安全=NTFS ACL，O=所有者資訊，U=審核資訊
/mir 複製所有目錄
/LOG+:文件:: 將拷貝資訊附加到文件中

一個晚上可以搬完 300G 的資料，再把第一層的資料夾(以範例來說，就是 RDFile 這個資料夾)開共享就可以了，權限因為有參數 /copyall，所以已經設定好了，只需檢查即可。

P.S /Log+ 這個參數會產生 Log 檔，他會詳細列出搬了多少個資料夾、多少個檔案，跳過哪些檔案，總共的資料量多大，每分鐘的搬移速度。

除了zhongcetw所說的robocopy之外,還有一個功能更強的xxcopy可以試試看
它的功能涵蓋robocopy的功能,但是還提供其他robocopy所切缺的...

XXCOPY的網站: http://www.xxcopy.com/index.htm

XXCOPY與ROBOCOPY的功能(參數)對應與比較: http://www.xxcopy.com/xxcopy30.htm

你需要的XXCOPY參數應該只有 /CLONE (目錄樹狀複製) 與 /SC (權限複製), 當然你也可以調整你需要的參數

您可以試試 Microsoft Windows Server 2003 的工具 Microsoft File Server Migration Toolkit
可以 online 把移至新的主機上,也可順便去做重新規劃,不重新規劃也沒關係,要看您的想法,重點之前設的權限也可以完整的搬遷過來.
載點如下:
http://www.microsoft.com/windowsserver2003/upgrading/nt4/tooldocs/msfsc.mspx
做法請參考:
http://www.wretch.cc/blog/josephphoto/11061408
希望對你有幫助

Microsoft File Server Migration Toolkit
http://www.microsoft.com/windowsserver2003/upgrading/nt4/tooldocs/msfsc.mspx
已轉移多台file server了

以上二種工具程式，這裡有比較、詳細說明
可以參考看看
史萊姆論壇
http://forum.slime.com.tw/thread159551.html