看完樓主的描述，應該樓主有些誤會
當然，廠商或是不熟悉或是沒說清楚
總之造成樓主觀念上有些混淆

1.一台防火牆好像只能對一台fortiswitch做fortilink
2.切vdom或著是擺L3 SWITCH去切vlan

以上，都是不適當的描述，Fortilink可以多個，但只有一個能用在GUI
如果，想要一次接多台FortiSwitch，也可以將FG-100D的port做硬體交換
然後做成Fortilink介面，然後接Fortiswitch，(但是，在下不建議這樣做)
所有完成連接的FortiSwitch，每個埠都可以直接選擇Vlan
Vlan與Vlan之間要通只要設定防火牆策略就好

下面，在下用簡單直述方式說明

1. 選1.2.3.4port做802.3ad
2. 將此介面配給Fortilink
3. 將第一台fortiswith的21,22,23,24port接上
4. Fortiswitch會自動重起，完成結構
5. 將其他剩餘的每台FortiSwitch的第23,24埠接上第一台任意埠
6. 剩餘的Fortiswitch會自動重啟，完成結構
7. FG-100D上會看到完整網路拓譜圖
8. 可以開始將每台FortiSwitch的埠口設定VLAN並做policy

以上，打完收工
注意：不用設Fortiswitch的IP，只管接網路線
注意：不用設路由，設VLAN不用敲指令，只管設防火牆政策就會通
注意：接上Fortiswitch的設備，可以用IP,mac,name，
10秒內找到switch接口，那怕有2000台設備也一樣快
如果想反過來設也可以，先接設備，用mac查找埠，點選設VLAN

如果樓主還是有搞不清楚的
那麼，可以私訊在下，或請原廠協助派送適合SI聯繫

你應該先做802.3ad Aggregate
把已經做好fortilink的p12 再多加上1到4port增加頻寬
綁再一起
fortilink底下的12 fortiswitch先上好vlan
應用公司現有架構
後面再嘗試把port1.2移到fortilink底下