上篇敘述兩種資料來源的傳染病監測系統，接下來將討論傳染病監測與資訊科技的未來發展趨勢。

• 整合相關監測資料
  由於各監視通報系統建立之目的與監測的性質不盡相同，所以並非所有系統均能相通，目前疾病管制署已將多數監測系統納入疫情資料倉儲系統，可整合性呈現某一疾病的監測資料，另對性質相近之監測系統進行合併，以簡化醫護人員通報之程序，並運用電子病歷交換傳染病通報資料交換。
• 提升防疫系統效能及運用行動科技
  資訊科技的技術日新月累，早年建置的系統必須汰舊換新，再行動科技運用上，2014年起疾病管制署辦理雲端都治(e-DOTS)，透過智慧型手機APP以視訊方式觀察病人服藥，取代傳統都治關懷員親自拜訪病患目視其服藥，此資訊應用軟體結合防疫作為。
• 應用大數據
  近年來大數據以為顯學，2015年，疾病管制署結合內政部統計區分類的概念及運用雲端大數據，釋出登革熱疫情群聚地圖，除保障病患隱私外，也供全民餐與登革熱防治。
• 開放資料加值應用
  配合雲端運算及行動服務時代來臨，加強整合運用政府開放資料(Open Data)，推動政府資料開放加值應用，疾病管制署目前於政府開放資料平台已開放超過209個資料集，供外界開發個應用，例如中央研究院團隊在2016年運用這些資料建置台灣傳染病標準化發生率地圖網站，幫助民眾掌握各項傳染病發生機率。
• 導入新興科技
  結合線上分析軟體、數理統計模式以及地理資訊系統，將傳染病的人、時、地分布情形做及時的整合性分析，以視覺化呈現結果，已建立疫情預警機制，將警訊透過電子郵件或簡訊等通訊軟體傳送，通知相關防疫人員及時進行防治工作，亦是未來發展趨勢。

參考:
醫學資訊管理學(華杏出版)