近幾年陸續發生的SARS、H7N9禽流感、H1N1新型流感、中東呼吸道症候群冠狀病毒感染症、茲卡病毒感染症等疫情，顯示出生物恐怖攻擊與新興傳染疾病的威脅與日俱增，為了有效因應這些傳染病帶來的攻擊，我們必須建立完善的傳染病監測及預警系統。

衛生福利部疾病管制署為實踐防疫資訊化之理念，對於本土流行性疾病，如季節性流感、腸病毒等，或對於新興傳染病，如禽流感、屈公病、茲卡病毒等疾病監測，依照世界各國對流行病情報偵測之架構，積極建構包含指標式 indicator-based與事件式 event-based兩種資料來源的傳染病監測系統。

• 指標式傳染病監測系統
  是指各種監測系統收集、分析及解釋各種數據資料，包含

1. 法定軟染病監視通報系統
2. 即時疫情監視及預警系統
3. 肺炎及流感死亡即時監測系統
4. 實驗室自動通報系統

• 事件式傳染病監測系統
  常以非官方資訊，如新聞媒體報導，進行國際疫情監測，疾病管制署在國家衛生指揮中心即設有媒體訊息室，及時收集國內外疫情。

用上述兩種傳染病監測系統來舉例(HINI新型流感)

2009年，美國CDC於台灣時間4月22日早上5點對外宣布發現兩個居住於南加州相鄰鄉鎮的小孩，均感染當時稱為豬流感(H1N1)的新型流感，疾病管制局於當日早上8時辰會即時掌握訊息，稍後接獲墨西哥已傳出至少造成62人死亡於此流感，我國於4月25日立即發布新聞，27日WTO公布H1N1病例定義，我國立即跟進並公告為第一類法定傳染病。
自發生疫情到5月20日，國內仍無病例，所以主要以事件式監測為主，並開始準備指標性監測系統，除原有病毒性感染合約實驗室、法定傳染病個案通報及RODS系統外，籌畫增加利用健保IC卡上傳資料與司王網路通報資料，進行每周類流感門診急診、住院與肺炎及流感死亡之即時監測，在疫情進入國內後，及以指標式監測系統為主進行國內疫情監測，事件式監測系統為輔收集國外疫情發展與整備情形、防疫措施等。

參考:
醫學資訊管理學(華杏出版)