PGO 與性能：JIT 可利用動態 PGO對熱路徑 inline 與 layout 最佳化，R2R 仍可在已預編碼方法上進行少量修補或 fallback JIT 生成更優版本。Native AOT 缺少執行時再最佳化階段，使用靜態 PGO 預收集 profile或 generic dictionary specialization。對長時間運行且熱點固定的服務，JIT 的動態 PGO 可給出更好 steady-state，對短命或 CLI 工具 Native AOT 更佳。

診斷與可觀測性：JIT 與 R2R 保留豐富 metadata，可使用反射列舉方法、使用 SOS / dotnet trace 收集 JIT 事件。Native AOT 在縮減 metadata 後某些事件簡化，仍支援 EventPipe 但型別資訊可能被折疊，需要在編譯時加上保留設定才能重現完整符號。調試 Native AOT 需要 PDB portable 與生成 map，IL 層面 stack trace 會較少語義資訊。

跨平台與部署：JIT/R2R 依賴平臺安裝對應 runtime，部署可以是 framework-dependent（最小）或 self-contained（包含 runtime）。Native AOT 一般輸出靜態連結（部分平台仍有少量動態依賴），極適合容器冷啟動與邊緣裝置。交叉編譯 Native AOT 需在目標平台對應 SDK 支援下加 RuntimeIdentifier rid。R2R self-contained 映像仍含完整 runtime，大小較 Native AOT 大。

JIT 適合複雜、需要動態組件載入與持續運行可長期受益於動態最佳化的服務；R2R 適合常規 Web/API/桌面應用，在基本不改寫程式的情況下獲得略佳啟動；Native AOT 適合命令列工具、函式運算平台伺服、容器極速啟動、IoT/邊緣、記憶體受限環境。當需第三方大量反射、動態代理、runtime code gen，暫緩 AOT 或逐步移除障礙。