免費的，印象中沒有自動重組功能的。
付費的推一套，PerfectDisk 除了支援windows 自動重組之外，也支援SQL server 及 Exchange server 資料庫的自動重組。

我都用windows 附的

大部份的情形下~我都是用Windows內建的磁磁重組工具...
但由於現在的HDD越出越大~有時還真是難搞...
每次重組HDD都要花上好幾個鐘頭...

之前是用power defragmenter 免費又很好用，在vista上沒試過，但是這個軟件好像也沒有更新了。
重要server上最好用付費的diskeeper比較安全而且自動低效能佔用在背景中就幫你重整了。

O&O Defrag也很棒！

The constant availability and high performance of servers is an absolute necessity for every company in order to ensure frictionless business operations on a daily basis. O&O Defrag 10 Server Edition is the perfect tool to make this possible.

O&O Defrag 10 Server Edition empowers you with the ultimate in defragmentation technology for your servers and workstations running Windows Vista, Windows XP, Windows Server 2003 and Windows 2000. For central management of O&O Defrag 10 in a network environment that can harness the convenience of your Active Directory service, simply turn to O&O Defrag's powerful network management console included with O&O Defrag 10 Server Edition. In addition, For the effortless roll-out of the O&O Defrag 10 software onto your network, you can choose between your own trusted software distribution solution or the built-in O&O ComponentInstaller in O&O Defrag 10 Server Edition

我都是使用 WinContig

◎.WinContig 是個免安裝的軟體，解壓縮後執行主程式，之後選擇【options】→【language】→【正體中文】，如此便可以有中文介面，然後由【新增】那裡開始選擇要重組的當案或資料夾。
◎.WinContig 支援單一檔案跟資料夾的重組功能。
◎.WinContig 也有快速跟智慧兩種模式可供選擇，實際測試的結果發現就算選智慧模式，該重組的速度還是相當快，並且也可以選擇對單一硬碟或者整部電腦進行重組。
◎.WinContig 可以讓你設定重組完後是否關閉程式或者直接關閉電腦喔，很棒的功能，也就是要關機前給他自己重組後關閉就可以不用力它了!!
◎.WinContig 在重組前可以先進行磁碟清理的功能，這樣可以先清掉一些垃圾在重組就更有效率了。

我都會使用Windows內建的磁磁重組工具
因為OS本身就有這樣的功能了
不必再安裝軟體
對硬體執行的速度有幫助
如果說你要另外安裝一些軟體
來幫助重組的話,
我覺得是反而影響電腦的執行速度
再說,另外安裝的那一套軟體
的程式有病毒的話,
那可說是自找麻煩

IObit SmartDefrag 參考看看！
http://www.iobit.com/iobitsmartdefrag.html?Str=download

我都用內建的
雖然沒有什麼自動重組功能
但我只知道一件事
東西要怎麼排
還是只有自己人最知道
用別的軟體來重組或許可以重組的很漂亮
但真是適合系統的讀取方式嗎??
為了保持系統運作的效能
卻又要增加系統的負載
這樣不是很矛盾嗎~~

用綠色的O&O Defrag
用Vopt XP 試用的吧
用微軟內建的比較多，雖然慢 但是也安全

UltimateDefrag 的基本特性有:

* 支援 FAT32/NTFS (Vista、XP、2003)。
* 介面直覺，可以很清楚看到檔案碎片分部在磁碟的哪部分，及它們的的名稱與位置。
* 可同時重組多個磁碟，可離線重組 MFT 和分頁檔。
* 可單獨重組某個檔案或資料夾。
* 可自行決定要如何分配檔案在磁碟上的位置。
* 分析與重組速度快。
* 僅需少許磁碟可用空間便可執行重組。
* 可使用排程工具定時自動執行重組。
* 可於螢幕保護程式啟動時自動執行重組。

Windows VISTA的重組軟體已經夠用了.幾分鐘到幾小時.磁碟應該已經完全一個一個重組過了.(類似以前的舊系統).services的.效能應該差不多吧.WATER.0911115854.( macosorawater@pchome.com.tw ). http://www.macosorawater.pchome.com.tw .小禮.Thanks. 11111111 .社會福利基金會. http://www.watertime.com.tw .

內建的真的是也不錯啦
感覺上...

有些電腦買來會附送這類的軟體，例如 ThinkPad 筆電內附的 DiskKeeper Lite 就是了。不過不管使用內建或外送的磁碟重組軟體，重點是只要有定期去做就好了。

我使用過 windows內建,NOrton Utility, VoptXP 三種
以VoptXP速度最快,其在執行前可 close背景run的其他process,不會一再重新來過.很好用.