如果不考慮經常攜帶的話,建議用3.5"的硬碟因為是價格比較好另一個因素是3.5"的硬碟轉速是7200RPM~10000RMP,另3.5"硬碟的快取記憶體也比較大16MB~32MB,搜尋存取資料量較快.
兩者的穩定度和使用壽命是差不多的, 在電源的供給方面因為USB口的電流理論峰值是500mA所以3.5"是需要外接電源否則無法啟動,2.5"320GB以上也建議外接電源.
因為現在硬碟的價格比和以前相比是便宜的太多了,基於成本的考量也不能說哪個牌子好,應該說都差不多,你可以找口碑不錯或是保固期長的,至少在保固期內壞掉可以免費換一個!
在資料的保存上如果有保存的必要建議還是燒錄出來.
另外建議外接式硬碟不使用時,可以讓他休息,這樣可以降低NB或PC的主板的電流負荷量.
大概是這樣了,希望對你有幫助!

兩者是否只有穩定度的差異?
不會

可接電源的是否比較穩?
不會

之前的3.5"外接似乎壞軌(壽命才兩年!!)，目前正在搶救中(汗)
資料一定要備份

考慮買2.5"的~~當然較方便漂亮
不帶來帶去, 3.5比較合算, 效能也好
裝個殼, 也漂亮

我也擔心用來下載影片會不會不穩
不會

我的使用經驗：

強烈建議你買一個e-sata的express卡（前提是你的nb有支援），搭配一個e-sata/usb2.0 combo的外接硬碟，3.5"硬碟的價性比是一定會比較好的。

接上e-sata使用，跟本機硬碟的速度一樣快，用過以後你就不會再考慮用usb了。

現在還有一種是2.5"/3.5"通用的，e-sata跟usb通吃（看機種型號，價格也有差啦，combo會比較貴），用來做備份、轉移系統速度都很快。我現在用這種，硬碟往上一插就可以用，不過這樣的設計只適合在桌面使用，不適合帶來帶去。

建議在賣外接盒時，不論是2.5吋或是3.5吋的外接盒，別買太便宜的外接盒
尤其是3.5吋的外接盒在電源供應器上，有的會不穩定造成硬碟的損壞

一分錢一分貨啊

不久前買了一台Seagate FreeAgent 640GB的 3.5"外接硬碟，感覺還不錯，
可以設定閒置多少時間後，外接硬碟自動進入省電模式，
還有定時備份的功能，感覺還滿超值的。

樓上都說得差不多了，我只提一點：
3.5吋的容量比2.5吋的大得多，也便宜些，以您下載影片又不需常攜帶來看，前者較划算！