可以把 年份 和 地區 當成鍵值，然後用程式將資料併起來

不過我看到 XLSX1 的最後一行 107 + 空白，轉換後變成 107 高雄市 這邊不是很懂 @@

程式使用 Epplus 套件。

# 程式

static void Main(string[] args)
{
    //讀取資料的函數
    IEnumerable<Hashtable> readData(string fileName, int startRowIndex = 0, int endColIndex = 0)
    {
        using (var package = new ExcelPackage(new FileInfo(fileName)))
        {
            var worksheet = package.Workbook.Worksheets.First();

            for (var i = startRowIndex; i <= worksheet.Dimension.Rows; i++)
            {
                var year = worksheet.Cells[i, 1].Text;

                //檢查年份，如果年份不對就停止讀取
                if (int.TryParse(year, out var r))
                {
                    //不想建立 Class 所以使用 Hashtable
                    var obj = new Hashtable();
                    for (var j = 1; j <= endColIndex; j++)
                    {
                        obj.Add($"Col{j}", worksheet.Cells[i, j].Text);
                    }
                    yield return obj;
                }
            }
        }
    }

    //讀取資料並轉為字典
    var file1 = readData("file1.xlsx",
        startRowIndex: 4, endColIndex: 6)
        .ToDictionary(it => new
        {
            Col1 = it["Col1"].ToString(),
            Col2 = it["Col2"].ToString()
        });

    //讀取資料並轉為字典
    var file2 = readData("file2.xlsx",
        startRowIndex: 4, endColIndex: 7)
        .ToDictionary(it => new
        {
            Col1 = it["Col1"].ToString(),
            Col2 = it["Col2"].ToString()
        });

    //產生年份對應表
    var result = file1.Concat(file2)
        //去除 Key 重複的資料
        .Select(it => it.Key).Distinct()
        //重新排序
        .OrderBy(it => it.Col1).ThenBy(it => it.Col2)
        //產生對應表，其餘欄位補空白
        .Select(it =>
        {
            var obj = new Hashtable();
            obj.Add($"Col1", it.Col1);
            obj.Add($"Col2", it.Col2);
            for (var i = 0; i < 9; i++)
                obj.Add($"Col{3 + i}", "");
            return obj;
        })
        .ToList();

    //將兩張表合併
    foreach (var item in result)
    {
        var key = new
        {
            Col1 = item["Col1"].ToString(),
            Col2 = item["Col2"].ToString()
        };
        //填入表一資料
        if (file1.TryGetValue(key, out var o1))
        {
            for (var i = 1; i <= 4; i++)
                item[$"Col{2 + i}"] = o1[$"Col{2 + i}"];
        }

        //填入表二資料
        if (file2.TryGetValue(key, out var o2))
        {
            for (var i = 1; i <= 5; i++)
                item[$"Col{6 + i}"] = o2[$"Col{2 + i}"];
        }
    }

    //匯出新檔案
    using (var package = new ExcelPackage())
    {
        var worksheet = package.Workbook.Worksheets.Add("工作表1");

        var rowIndex = 4;

        foreach (var item in result)
        {
            for (var colIndex = 1; colIndex <= 11; colIndex++)
            {
                worksheet.Cells[rowIndex, colIndex].Value = item[$"Col{colIndex}"].ToString();
            }
            rowIndex++;
        }

        package.SaveAs(new FileInfo("new.xlsx"));
    }
}

# 測試資料

# 結果

加上標題並調整一下樣式就可以了。

我只能將大約的邏輯給你。

畢竟我不知道c#能用的東西及工具有哪些。期待有其它人能告訴你。

1.試著往將xls讀取後，先轉成資料變數。

2.從程式中處理好及整理成你要的格式。

3.再將整理好的資料，重新輸出成一個新的xls。

依照你的實例結果，你因該只做到將資料往下貼的動作而已。
可能只是單純的合拼作用。

畢竟你想要的結果，格式是需要改變的。不先讀取成資料變數。
很難做直接操作才對(我不確定就是了)

你去nuget下載epplus

然後用下列指令，即可把a.xlsx(來源)的sheet1工作表，加到b.xlsx(目的)的工作表群裡

using (ExcelPackage epA = new ExcelPackage(new System.IO.FileInfo("a.xlsx")))
{
    using (ExcelPackage epB = new ExcelPackage(new System.IO.FileInfo("b.xlsx")))
    {
        var sheetA = epA.Workbook.Worksheets["sheet1"];
        epB.Workbook.Worksheets.Add("來自a的sheet1", sheetA);
        epB.Save();
    }
}

速度超快，且免安裝OFFICE，也無需掛載任何COM或interop，我用在webserver上就不用為了匯出EXCEL檔而安裝一套OFFICE(效能也太..)

個人目前在使用的是OpenXmlSdk套件，一樣可以在nuget下載(名稱DocumentFormat.OpenXml)，
要合併的話其實可以先讀檔，在重新寫一份新的檔案，不過這樣做其實會有記憶體資源的問題(如果資料越多的話記憶體占用也會增加)，
中間你要做任何處理你自行決定，
不過這個讀excel檔會有遇到中文需要從ShareStringTable取值的問題(寫個方法解決即可)