用Python或Cmd擷取xml檔內指定資料

python batch xml

wowcat 2021-01-29 23:02:39 ‧ 3352 瀏覽

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我有一個資料夾，目錄結構如下:
sample
--object
--people
--animal

xml範例如下:

DataOut_1.xml
<PDataset>
  <PAMRandom B="1"> 
    <Metadata>
      <MDI key="SMA">1502</MDI>
      <MDI key="SME">3.14</MDI>
    </Metadata>
  </PAMRandom>
  <PAMRandom B="2">
    <Metadata>
      <MDI key="SMA">3394</MDI>
      <MDI key="SME">24.2628</MDI>
    </Metadata>
  </PAMRandom>
</PDataset>

三個資料夾內各有一大堆的xml檔案，我想將特定的內容擷取出並另存成如下方範例的CSV或ODS檔。

Name,B1_SMA,B1_SME,B2_SMA,B2_SME
DataOut_1,1502,3.14,3394,24.2628

參考一些教學後，目前只能做到擷取字串，卻一直無法擷取指定元素的內容，請問這個問題該如何解呢? 解法不限Python，Cmd寫成的批次檔也可以。

謝謝各位 :D

最後附上跑不動的Python

from lxml import etree
import pandas as pd
tree = etree.parse("DataOut_1.xml")
df = pd.DataFrame({
   "B1_SMA" : tree.xpath('/PDataset/PAMRandom/Metadata/MDI*[@key='SMA']'),
})

df.to_csv("output.csv", sep=",", index = None)

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2 個回答

ccutmis

iT邦高手 2 級 ‧ 2021-01-30 00:19:23

正統的作法可能是要用類似xpath去取得xml節點內容，
不過我個人比較偏愛用正則(RegularExpression)來解，
這邊提供一個土法煉鋼的方法，用 Re.findall 將符合的結果存為串列(list)
然後就是把結果重排成你要的格式並存為與xml檔同名的csv檔，Done!
以下範例在macos運作正常，如果你是在windows作業系統執行可能需要把第11行的 .replace('\n','') 改成 .replace('\r\n','')

DataOut_1.xml

<PDataset>
  <PAMRandom B="1"> 
    <Metadata>
      <MDI key="SMA">1502</MDI>
      <MDI key="SME">3.14</MDI>
    </Metadata>
  </PAMRandom>
  <PAMRandom B="2">
    <Metadata>
      <MDI key="SMA">3394</MDI>
      <MDI key="SME">24.2628</MDI>
    </Metadata>
  </PAMRandom>
</PDataset>

extract_xml.py

import re

# 取得完整檔名(不含路徑)
def get_file_fullname(input_str):
    return input_str.split("/")[-1] # for linux or macos
    # return input_str.split("\\")[-1] 如果是在windows要改成這樣寫

def extract_from_xml(xml_file,save_file):
    with open(xml_file,'r',encoding='utf-8') as f:
        xml_content=f.read().replace('    ','').replace('\n','')
    #print(xml_content)
    RE_RULE=r'<PAMRandom B="([^"]+)">.*?<Metadata>.*?<MDI key="([^"]+)">([^<]+)</MDI>.*?<MDI key="([^"]+)">([^<]+)</MDI></Metadata>.*?</PAMRandom>'
    tmp_list=re.findall(RE_RULE, xml_content)
    print('XML EXTRACT TO LIST:\n',tmp_list)
    #將match結果排成需要的格式
    LINE1="Name,B{}_{},B{}_{},B{}_{},B{}_{}\n".format(tmp_list[0][0],tmp_list[0][1],tmp_list[0][0],tmp_list[0][3],tmp_list[1][0],tmp_list[1][1],tmp_list[1][0],tmp_list[1][3])
    LINE2="{},{},{},{},{}\n".format(get_file_fullname(xml_file).split(".")[0],tmp_list[0][2],tmp_list[0][4],tmp_list[1][2],tmp_list[1][4])
    print('='*30)
    print(LINE1+LINE2)
    #存為同檔名的csv
    with open(save_file,'w',encoding='utf-8') as f:
        f.writelines(LINE1)
        f.writelines(LINE2)

extract_from_xml('DataOut_1.xml','DataOut_1.csv')

執行結果:

$ python3 ./read_xml.py
EXTRACT TO LIST:
 [('1', 'SMA', '1502', 'SME', '3.14'), ('2', 'SMA', '3394', 'SME', '24.2628')]
==============================
Name,B1_SMA,B1_SME,B2_SMA,B2_SME
DataOut_1,1502,3.14,3394,24.2628

DataOut_1.csv

Name,B1_SMA,B1_SME,B2_SMA,B2_SME
DataOut_1,1502,3.14,3394,24.2628

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wowcat iT邦新手 5 級 ‧ 2021-01-30 10:34:58 檢舉

感謝ccutmis，你的程式碼在Colaboratory上是可行的!

只是不知道如果增加能讀取子資料夾下的xml並輸出成CSV的功能，會不會需要大改 XD

ccutmis iT邦高手 2 級 ‧ 2021-01-30 10:55:17 檢舉

增加能讀取子資料夾下的xml並輸出成CSV的功能

可以參考一下這篇文章裡面我的回覆(把 xlsx 改成 xml 原理是一樣的)需要另外寫的是你的存檔路徑怎麼設還有記得要測試前記得先把所有檔案備份喔
https://ithelp.ithome.com.tw/questions/10201953

結合這篇的範例可能會像這樣


# 取得特定資料夾底下的檔案列表
# allow_file_type可指定檔案類型(未指定就是列出所有類型)
def dir_list(dir_loc,allow_file_type=[]):
    ...略...

# 要執行的程式 這邊稍作修改 加上了 save_file 參數
def extract_from_xml(xml_file,save_file):
    ...略...

# 取得副檔名格式
def get_file_type(file_path_and_name):
    ...略...

# 取得完整檔名(不含路徑)
def get_file_fullname(input_str):
    ...略...

if __name__ == '__main__':
    xml_dir_path=r"C:\xmlHere\"
    csv_dir_path=r"C:\csvHere\"
    xml_list=dir_list(xml_dir_path,["xml"])
    for i in xml_list:
        save_file_full_path=csv_dir_path+(get_file_fullname(i).replace(".xml",".csv"))
        extract_from_xml(i,save_file_full_path)

P.S: