Python Documentation：

Note that relative imports are based on the name of the current module. Since the name of the main module is always "__main__", modules intended for use as the main module of a Python application must always use absolute imports.

相對 import 的運作是以目前的模組名稱為依據。因為主模組的名稱永遠是 "__main__"，所以如果一個模組預期被用作 Python 應用程式的主模組，那它必須永遠使用絕對 import。

以及 PEP 328：

Relative imports use a module’s __name__ attribute to determine that module’s position in the package hierarchy. If the module’s name does not contain any package information (e.g. it is set to ‘__main__’) then relative imports are resolved as if the module were a top level module, regardless of where the module is actually located on the file system.

相對 import 通過使用模組的 __name__ 屬性來確定模組在包層次結構中的位置。如果該模組的名稱不包含任何包資訊（例如，它被設定為 __main__），那麼相對 import 會認為這個模組就是頂層模組，而不管模組在檔案系統上的實際位置。

意思是，當你直接運行 moduleX.py 的時候，moduleX.py 是程式的入口點 (Entry point)，因此 __name__ == "__main__"，moduleX.py 被認為是頂層 module，上面再沒有其他的 module。

解決方案一

建立 root_directory 及 root.py，從 root.py 調用 moduleX.py，令 root.py 成為頂層

root_directory 
├── root.py 
└── package 
	├── __init__.py 
	├── subpackage1
	|	├── __init__.py
	|	└── moduleX.py
	└── subpackage2
		├── __init__.py
		└── moduleZ.py

# root.py
from package.subpackage1 import moduleX

# moduleX.py
from ..subpackage2.moduleZ import egg
egg()

# moduleZ.py
def egg():
    pass

解決方案二

package 
	├── subpackage1
	|	├── __init__.py
	|	└── moduleX.py
	└── subpackage2
		├── __init__.py
		└── moduleZ.py

# moduleX.py
from package.subpackage2.moduleZ import egg
egg()

# moduleZ.py
def egg():
    pass

把 moduleX.py 當成 module 來執行：

$ python -m package.subpackage1.moduleX

解決方案三

各式各樣的添加路徑

繼續深入研究方向：
__name__、__package__

分析過程：
https://stackoverflow.com/questions/16981921/relative-imports-in-python-3
https://stackoverflow.com/questions/30669474/beyond-top-level-package-error-in-relative-import