當出現「操作無法完成，因為磁碟區不乾淨。請執行 chkdsk 然後再試一次。」的訊息時，代表磁碟的內容可能是處於不一致的狀態。
理論上，Windows Server 在開機時，會自動啟動 autochk.exe，來檢查磁碟機的「已變更位元」(Dirty Bit) 是否有被設定，如果有，autochk.exe 會再執行 chkdsk.exe /f 來檢查磁碟。
要知道某個磁碟機是不是乾淨的，可以透過 fsutil.exe 這個工具來取得相關資訊。
例如要查詢 C: 磁碟機：
fsutil dirty query C:
結果會是下面兩種之一：
磁碟區 - c: 未變更
磁碟區 - c: 已變更
假設已經知道 C: 磁碟機不乾淨，輸入以下的指令即可進行修復：
chkdsk /f c:
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