當使用者要比較 x86 系統與 UINX 系統時，這裡的 UNIX 系統指的是獨立的軟硬體設備供應商所提供的 UNIX 系統，像是 IBM Power 晶片架構的 AIX、HP Itanium 晶片架構的 HP-UX、以及 Oracle-Sun Sparc 晶片架構的 Solaris，而 x86 系統則泛指那些採用 Intel 或 AMD x86 晶片架構的 Windows、Linux 或其他系統。在市場定位上，UNIX 系統通常站在高端市場，而 x86 系統通常涵蓋中低端的市場。
對於如何選擇 x86 或 UNIX 系統，通常會從以下幾個觀點去思考：效能、可靠度、擴展性、容錯能力、整體擁有的成本 (TCO)，以及作業系統和應用程式的支援等等。由於各家的 UNIX 系統接對其軟硬體有整合性的開發與測試，所以其可靠度與容錯能力比較好；但是因為 x86 有眾多的供應商，所以軟硬體與周邊設備較多樣化，而且整體成本相對較低。
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