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我們的基因體時代-Web3 & 去中心化科學DeSci系列 第 19

我們的基因體時代-Web3 & 去中心化科學DeSci: pRoots

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前幾篇介紹了gitcoin,以及其他的生態系統,和背後希望為善的初衷,以及藉由區塊鏈能給予這世界的好處。這邊則介紹這次趁GR15的期間,針對自己平常在處理基因資料遇到的問題以及相關去中心化科學的想法,建立了一個項目叫做pRoots,在這次GR15期間,算是亞洲區域去中心化科學項目獲得最多支持的一個項目,在這次的項目宣傳中,我們也學到很多,從實際參與的過程發現,這是一個台灣要跨出國際相對可行的路線,藉由科學這個共通的語言,搭配區塊鏈無國界的特性。

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pRoots是為了賦予人們能方便儲存、分享、註釋和學習基因資料並建立信譽的去中心化工具,最終目標是希望建立以基因資訊為媒介的合成生物學開源合作網絡。

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近五年以來,基因科技的進步,除了讓基因定序、合成和修改基因的成本大幅下降,加速了使用生物技術來解決農業、食物、能源、醫療、材料的機會,除此之外,自造者運動、便宜的3D列印風氣,帶起草根生技創業的趨勢。其中一個會遇到的問題是,許多重要的基因資料,沒有一個好的方式能分享基因資料和註解。許多生物開源實驗室願意分享,但在跨國經費和資料分享上,相對困難,而如今區塊鏈技術建立起了網路原生金融體系,和去中心化的儲存設施剛好可以打破這障礙。

另外,今年開始許多專注在生醫領域之去中心化的自治組織(DAOs)開始出現,像是MoleculeDAO、LabDAO、BioDAO
、VitaDAO、ValleyDAO等等,主要以使用加密貨幣進行生醫研究贊助,目前處理細節的工具尚無出現,而 pRoots 便能用來提供DAO在贊助研究後,讓研究產出的基因資訊,能使用貢獻到開源的知識基因網絡上。同時,贊助的數位貨幣也能很原生地提供給相對應的研究團隊或個人。

階段一

能讓科學家、開源實驗室或是公民科學家使用pRoots儲存、分享並且註釋基因資訊。
介面提供簡易的基因資料視覺化和編輯工具。
能讓DAOs使用pRoots提供資助對象相關基因資料的基本設施功能,如儲存、分享和註釋。

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階段二

提供一個基因資料分享網絡,讓人跟人可以藉由註釋或是分享類似基因資訊而形成關係,建立於基因共享興趣的合作網路(研究啤酒酵母基因的人們可以因此發現彼此)。
建立一個連結開源生物領域工具和資料網站的資料結構,並且建立類似基因策展的基因,能將一些很棒的開源基因資料,從web2橋接到web3的世界,並且人們可以在這些知識上面形成社交網絡和註釋。

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階段三

將pRoots的API設計完成,讓DAOs可以使用pRoots的API來進行資料合約,比如將贊助的加密貨幣,一部分已儲存空間的方式給予贊助對象,但合約條件為對象必須將相關基因資料產出分享到pRoots搭建的知識網絡。
個人也可以藉由pRoots的API進行資料合約,比如位在歐洲的啤酒酵母業餘科學家,想要委託墨西哥社區實驗室的科學家定序當地酵母菌基因,便能藉由pRoots API進行鍊上資料合約。

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在這次短短的幾週內,很神奇的也獲得鏈圈朋友的支持,也在這次的參與過程,獲得比旁觀者更深的體悟,或許未來真的會有脫離政府資金,獨立運作的科學研究社群,這趨勢在美國已經運作許久,而台灣可能才開始。

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我們的基因體時代是我經營的部落格,如有對於合成生物學、生物資訊、檢驗醫學、資料視覺化、R語言有興趣的話,可以來交流交流!


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