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共有 9 則文章
鐵人賽 自我挑戰組 DAY 11

技術 Day11:儲存解析結果並進行驗證

在成功爬取和解析基因的起始與結束位置之後,我需要將這些數據保存下來,並進行驗證,以確保數據完整且無誤,今天的目標是將解析出的基因位置信息儲存到一個 Excel...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 9

技術 Day9:非同步爬蟲爬取基因詳細頁面

在處理大量基因數據時,使用同步爬蟲效率會很低,因此今天我將使用 aiohttp 來執行非同步爬蟲,這樣可以加速數據抓取過程。非同步爬蟲允許同時發送多個請求,而不...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 8

技術 Day8:基於 Ensembl Gene ID 構建基因詳細頁面的 URL

今天我要建構基因詳細頁面的 URL 模板,用以後續爬蟲。 在進行網頁爬蟲時,必須準確的知道要爬取的網頁之 URL 構建方式;今天我將使用每個基因的 Ensemb...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 7

技術 Day7:理解 Ensembl 網站的基因詳細頁面結構

今天我將專注於理解 Ensembl 網站上基因詳細頁面的結構,這對於後續爬取基因的起始和結束位置至關重要。在 Ensembl 網站的基因詳細頁面中,包含了基因的...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 6

技術 Day6:清理數據並驗證基因代號轉換結果

今天主要著重在清理轉換後的數據,並進行驗證。 基因代號轉換後,我需要對結果進行清理和驗證,因為有些基因雖然有 Symbol ID,但其在 Ensembl 上並未...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 5

技術 Day5:執行基因代號轉換

今天我要進行 Symbol ID 到 Ensembl Gene ID 的轉換。 Day4 已設置好基因代號轉換工具,接下來我將使用 Ensembl BioMar...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 3

技術 Day3:讀取 Excel 文件與提取基因代號

為了完成此次挑戰,必須先有基因表達數據以供分析,因此我下載了來自 NCBI GEO 之基因數據以供後續使用。 NCBI GEO 介紹 NCBI GEO 是美國國...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 4

技術 Day4:建構基因代號轉換工具

在後續的網頁爬蟲中,我利用 Ensembl Gene ID 作為數據的基礎,因此我需要先將從 NCBI GEO 下載的基因 Symbol ID 進行轉換。 轉換...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 2

技術 Day2:環境配置與依賴安裝

在正式開始之前,我需要先建立開發環境並安裝必要的依賴庫。為了成功處理基因數據,構建一個穩定且高效的開發環境是關鍵。因此,今天的重點將放在環境設置及依賴庫的安裝上...