鐵人檔案
這篇是獻給所有要做16S Metagenomic的學子們， 無論你是專題生、研究生， 無論是做人類、動物、水質、土壤，只要跟菌相有關一律適用! 次世代還是第三代定序通通都介紹，文中著重於分析軟體操作、資料處理、資料視覺化解讀及菌相功能預測的應用，就讓修過高中生物教程的傢伙，用淺白生動的話講給你聽!
次世代定序 16S rRNA 生物資訊分析教學地圖 本系列文前20篇以次世代定序(NGS) 16S rRNA分析教學為主，並以相同範例檔案貫穿各篇，分析流程具有...
短片段且解析度有限的 NGS 次世代定序 在 [Day 05] 的 16S rRNA 介紹中，曾經提及 NGS 的技術限制在單條超過 300 bp 品質就會急速...
三代定序分析主程式 pb-16S-nf v0.3 QIIME2 對於二代定序資料高度支援，但在第三代定序的資料相容性上仍未完善，本篇採用由 PacBio 官方於...
準備第三代定序分析所需的輸入檔案 pb-16S-nf 沿襲了 QIIME2 [Day 06] 的特色，同樣需要下列輸入檔案，在格式上與次世代相當類似 : 定序...
執行 pb-16S-nf 第三代分析與檔案簡介 有別於 QIIME2 一步一步手動輸入指令處理，pb-16S-nf 與 PICRUSt2 一樣提供單一指令執行全...
資料前處理、品質管制、物種分配的視覺化 pb-16S-nf 本身即整合 QIIME2 軟體緣故，所產出的圖檔幾乎相同，本篇則先介紹資料前處理、品質管制、物種分配...
分析跑完欲更動註釋資料 (metadata) 的組別 實務上常常會在分析後看著結果圖，想更改/新增/刪除組別分類看看，若每次都要重頭跑分析實在太麻煩了，其實只要...
第三代定序 16S rRNA 生物資訊分析教學地圖 第三代定序分析大部分承襲 NGS 次世代定序，學習上若有次世代分析基礎會更得心應手，本篇以未曾學過次世代定序...
沒有寫過程式就不會遇到 BUG 本篇介紹執行定序分析常見的報錯情境，而報錯的方式千百種，查詢解決方法就一種 :錯誤訊息複製起來，扔到 Google 就對了不過總...
再往前一步，定序分析教學資源分享 官方資源 QIIME2 技術文件 學會看技術文件是工程師的必修課程，儘管 QIIME2 的前端排版實在是有點難下嚥，由於所...
