雖然kintone作為一個資料管理和系統整合平台具有多項優點，但在實際使用中，仍然存在一些需要注意的缺點和限制，可能會影響某些企業或使用者的體驗。以下是一些kintone缺點分析：

1. 通常需要客製化：雖然目前kintone所提供的基礎功能並不少，但還是稍嫌不夠，下拉選單連動，發Mail給使用者以外的地址，計算欄位的函數，欄位資料格式自動調整 等等，這些功能在其他的系統中可能是基礎功能，但在kintone上需要另外進行開發。

2. 生態圈還未完成(台灣)：kintone在日本生態圈已經相當完整，任何kintone不足的功能幾乎都已經可以透過其他代理廠商導入，但在台灣，kintone的生態圈目前還在建立中，代理廠商的開發能力也有限，對於某些特別功能需求的客戶，或者較大型的公司，在導入前可能要先考慮清楚。

3. 報表和分析功能有限：kintone的報表和分析功能相對簡單，適合基本的數據可視化和簡單分析，但在進行更深入的數據分析時，可能顯得不足。對於需要強大分析能力的企業來說，kintone可能需要與其他專業數據分析工具結合使用，或者額外進行客製化開發。

4. UI/UX 的設計受限：雖然kintone的UI簡單易用，但這種設計也限制了系統的美觀和功能多樣性。使用者在進行界面設計時，可能會發現自定義選項較少，無法完全根據企業的品牌需求進行界面設計，這在某些需要強調使用者體驗的情境下可能會是一個缺點。

5. 權限管理的細節複雜：儘管kintone提供了詳細的權限管理功能，但由於其設置過於細緻，反而可能讓系統管理變得複雜。當有多個層級的權限需要管理時，管理員可能需要投入大量時間來確保權限設定正確，這增加了維護的負擔。

6. 成本問題：kintone是一個 SaaS（軟體即服務）平台，其定價模式可能不適合所有企業。(限制最少５ID)
   對於一些中小型企業來說，長期訂閱的成本可能會逐漸累積，並超出預算。與此同時，kintone的定價也可能會限制一些企業在功能使用上的靈活性，特別是當企業需要擴展功能或增加用戶數量時，成本可能迅速增加。

kintone作為一個靈活的資料管理平台，適合於中小型企業或具有基本需求的使用者，但其在高度客製化、複雜分析、成本控制以及系統整合等方面的限制，可能會對某些企業帶來挑戰。在選擇kintone作為企業的主要管理平台之前，深入了解這些潛在的缺點並權衡其優劣是非常重要的。