前面兩篇文章中,我們介紹了 FHIR 用於交換臨床資料與脈絡。今天介紹如何傳遞醫療影像。
等等,在開始之前,你可能會想說:「欸?FHIR 沒有辦法傳遞醫療影像嗎?」
這邊簡單說明一下,FHIR 是專注於跨系統臨床文字與結構化數據交換的標準,例如病歷、診斷、藥物跟生理跡象等等,雖然 FHIR 可以描述影像、引用影像,但不適合承載大量像素資料。
它主要是使用輕量化的 JSON、XML 格式,以模組化來作為它的資料類別。在傳遞方式上,FHIR 定義資料格式與 API 互動;認證、授權方式依實作和安全框架而定,OAuth 2.0 並非所有 FHIR 傳輸的固定要求。
但是醫療場景當中經常會用到的影像資料,例如電腦斷層、核磁共振、X 光、超音波等等高解析度的數位病理切片。傳統單純的文字,或者是傳統的 JPEG、PNG 圖片,缺少完整脈絡(病人、檢查、位置、單位),以及位元深度和灰階資訊。
所以接下來要介紹的是 DICOM 醫療影像格式。
醫療數位影像與傳輸標準(DICOM,Digital Imaging and Communications in Medicine),它是由美國電氣製造商協會(NEMA)與美國放射學會(ACR)於 1980 年代共同制定,它專注於醫療影像的拍攝、儲存、傳送,定義了資料模型、資料格式以及網路通訊協定,
與一般的影像不太一樣:它是依物件類型包含影像或其他資料,以及相關中繼資料;不是每個 DICOM Instance 都是像素矩陣。
DICOM 常用 Patient → Study → Series → Instance 階層組織影像資料:
StudyInstanceUID。它不等同整次就醫;一次就醫可能包含多個 Study。SeriesInstanceUID。不同拍攝角度或掃描設定可能形成不同 Series,但不只依這兩個條件決定。SOPInstanceUID。它可能是單張影像、多影格影像,也可能是報告或波形等其他物件,不一定是二維切片。一個典型的 DICOM 檔案(.dcm)由兩大核心元素組成:
Header(中繼資料 / Metadata):
(Group, Element) 兩組十六進位碼組成,例如 (0010,0010) 代表 Patient Name,(0008,0060) 代表 Modality 檢查儀器類別)。Pixel Data(影像像素資料):
一個 DICOM 範例如下:
{
"00080016": {
"vr": "UI",
"Value": ["1.2.840.10008.5.1.4.1.1.2"]
},
"00080018": {
"vr": "UI",
"Value": ["2.25.1000001"]
},
"00080060": {
"vr": "CS",
"Value": ["CT"]
},
"00100010": {
"vr": "PN",
"Value": [
{
"Alphabetic": "SAMPLE^PATIENT"
}
]
},
"00100020": {
"vr": "LO",
"Value": ["PATIENT-001"]
},
"0020000D": {
"vr": "UI",
"Value": ["2.25.2000001"]
},
"0020000E": {
"vr": "UI",
"Value": ["2.25.3000001"]
},
"00200013": {
"vr": "IS",
"Value": [1]
},
"00200032": {
"vr": "DS",
"Value": [0, 0, 0]
}
}
| Tag | 意義 |
|---|---|
00080016 |
SOP Class UID:此物件類型為 CT Image Storage |
00080018 |
SOP Instance UID:此影像物件的唯一識別碼 |
00100010、00100020 |
病人姓名與識別碼 |
0020000D |
Study Instance UID |
0020000E |
Series Instance UID |
00200013 |
Series 內的影像編號 |
00200032 |
影像位置 |
註:同一個 Study 可包含多個 Series;同一個 Series 可包含多個 Instance。多張 CT 切片通常各自有不同的 SOPInstanceUID,但共用相同 Study 與 Series UID。此處影像像素資料省略。 |
JPEG 或 PNG 可以呈現影像,但單獨一張圖片通常不足以保留醫療系統需要的完整脈絡,例如病人、檢查、序列、設備與影像位置等資訊。這些資訊有些存在 DICOM 中繼資料,有些則透過 Study、Series、Instance 之間的關係連結。
以電腦斷層(CT)為例,一次檢查通常會產生一組影像切片。系統需要知道哪些影像屬於同一個 Study 和 Series,以及每張影像在影像堆疊中的位置,才能正確瀏覽與重建影像。若只匯出單張 JPEG/PNG,這些關係和部分中繼資料可能無法一併保留。
今天簡單介紹了 DICOM 的格式,我們知道在醫療領域當中,醫療資訊不是只能透過 FHIR 來記錄,醫療影像可以透過 DICOM 來進行儲存、傳遞,搭配兩者來使用更能將醫療資訊完整保留。