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鐵人賽 自我挑戰組 DAY 16

技術 [Day 16] 分析Copy number variation系列 (壹)

昨天我提到了CNV 在昨天開啟了copy number variation系列文的篇章之後,簡單地介紹了CNV是什麼,以及CNV的生物意義,今天我將來介紹目前常...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 15

技術 [Day 15] 分析Copy number variation系列(零)

關於這系列 我預計用4+1篇的篇幅來講一下關於所謂的拷貝數變異的問題、如何分析拷貝數變異、有哪些演算法及實作,以及最後的在Julia底下該怎麼來分析這種資料。...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 17

技術 [Day 17] 分析Copy number variation系列 (貳)

繼續昨天的話題 昨天的文章簡單地介紹了幾種偵測CNV的實驗方法及其原理,原本想繼續寫關於CNV-calling的東西,不過這幾天實在是休息不夠,狀態不是很好。這...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 18

技術 [Day 18] 分析Copy number variation系列(參)

昨天介紹了分析Array-based資料當中CNV的一種方法 所以今天就不意外地要介紹一下目前用來分析NGS資料當中CNV的方法了!根據Computationa...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 19

技術 [Day 19] 分析Copy number variation系列(肆)

回顧一下前兩天 在前兩天的文當中,我分別介紹了應用在SNP array及NGS資料上的CNV-calling方法,今天就來看看如果我想使用julia底下的工具來...

鐵人賽 自我挑戰組 DAY 24

技術 [Day 24] 繼續關於CNV的部份

Read-depth 由於這陣子在搞的東西跟CNV有非常大的關係,所以也陸續參考了不少文獻。前面我提過了絕大多數的演算法都是基於read depth這個值衍生出...