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鐵人賽自我挑戰組 DAY 16

When Bioinfo met Julia: Bioinformatician的30天Julia學習之路系列第 17 篇

技術 [Day 16] 分析Copy number variation系列（壹）

昨天我提到了CNV 在昨天開啟了copy number variation系列文的篇章之後，簡單地介紹了CNV是什麼，以及CNV的生物意義，今天我將來介紹目前常...

nostalgie1211 ‧ 2018-10-17

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鐵人賽自我挑戰組 DAY 15

When Bioinfo met Julia: Bioinformatician的30天Julia學習之路系列第 16 篇

技術 [Day 15] 分析Copy number variation系列（零）

關於這系列我預計用4+1篇的篇幅來講一下關於所謂的拷貝數變異的問題、如何分析拷貝數變異、有哪些演算法及實作，以及最後的在Julia底下該怎麼來分析這種資料。...

nostalgie1211 ‧ 2018-10-16

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鐵人賽自我挑戰組 DAY 17

When Bioinfo met Julia: Bioinformatician的30天Julia學習之路系列第 18 篇

技術 [Day 17] 分析Copy number variation系列（貳）

繼續昨天的話題昨天的文章簡單地介紹了幾種偵測CNV的實驗方法及其原理，原本想繼續寫關於CNV-calling的東西，不過這幾天實在是休息不夠，狀態不是很好。這...

nostalgie1211 ‧ 2018-10-18

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鐵人賽自我挑戰組 DAY 18

When Bioinfo met Julia: Bioinformatician的30天Julia學習之路系列第 19 篇

技術 [Day 18] 分析Copy number variation系列（參）

昨天介紹了分析Array-based資料當中CNV的一種方法所以今天就不意外地要介紹一下目前用來分析NGS資料當中CNV的方法了！根據Computationa...

nostalgie1211 ‧ 2018-10-19

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鐵人賽自我挑戰組 DAY 19

When Bioinfo met Julia: Bioinformatician的30天Julia學習之路系列第 20 篇

技術 [Day 19] 分析Copy number variation系列（肆）

回顧一下前兩天在前兩天的文當中，我分別介紹了應用在SNP array及NGS資料上的CNV-calling方法，今天就來看看如果我想使用julia底下的工具來...

nostalgie1211 ‧ 2018-10-20

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鐵人賽自我挑戰組 DAY 24

When Bioinfo met Julia: Bioinformatician的30天Julia學習之路系列第 25 篇

技術 [Day 24] 繼續關於CNV的部份

Read-depth 由於這陣子在搞的東西跟CNV有非常大的關係，所以也陸續參考了不少文獻。前面我提過了絕大多數的演算法都是基於read depth這個值衍生出...

nostalgie1211 ‧ 2018-10-25

技術 [Day 16] 分析Copy number variation系列 （壹）