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DAY 28
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AI & Data

我們的基因體時代-AI, Data和生物資訊系列 第 28

我們的基因體時代-AI, Data和生物資訊 Day28-COVID大數據:資料哪裡來

上一篇我們的基因體時代-AI, Data和生物資訊 Day27-進階人工智慧在分子生物學之應用又是明顯的偷懶,之後會再好好補一下,感覺可能要比30天還長很多,才能讓這些主題更將的論述完畢!為了能對應到當初提到的COVID相關的主題,這邊再度往前跳躍,這次COVID疫情,已經快要兩年了,其實全世界生醫領域也因此有很多驚人的突破,其相關衍生的資料也非常多,畢竟各國需要合作,很多數據需要共享,這邊先介紹一些開源跟COVID相關的資訊來源!

可串皆之開放API

https://ithelp.ithome.com.tw/upload/images/20210928/20103989HWmNMYjbBX.png
Disease.sh是一個開放API,提供根COVID相關的統計資料,其匯集來自14個地方
covidAPI也提供另一個JSON相容前端的接口
https://ithelp.ithome.com.tw/upload/images/20210928/20103989I0DoeeJ3rb.png

重要的資料來源

美國約翰霍普金斯COVID19資料中心
https://ithelp.ithome.com.tw/upload/images/20210928/20103989haL7fLhMAg.png
這算是目前最重要的一個資料來源,裡面有各國的每日統計資料包含新確診人數、28天確診總人數、死亡人數,目前還新增有疫苗接種人數的資訊,同時裡面還有搭配世界地圖的視覺化圖表。

Nextstrain是一個獲得臉書基金會補助的開源基因資料專案,其是目前最重要的病毒株基因序列變化的分析資料平台。
https://ithelp.ithome.com.tw/upload/images/20210928/20103989eXyCuluJTI.png
Nextstrain很特別的地方是除了本身匯集許多菌種定序資料外,本身也提供開源之分析系統,
https://ithelp.ithome.com.tw/upload/images/20210928/20103989VxjUaXrA81.png

閱讀參考


這個月的規劃貼在這篇文章中我們的基因體時代-AI, Data和生物資訊 Overview,也會持續調整!我們的基因體時代是我經營的部落格,如有對於生物資訊、檢驗醫學、資料視覺化、R語言有興趣的話,可以來交流交流!


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