為什麼昨天剛處理完畢的問題，幾個星期或幾個月之後又會重複發生？為什麼我們好不容易解決了一個問題之後，卻又另外跑出其他好幾個問題？我們平常慣用檢視的因果關係，似乎只能讓我們找出錯誤的根本原由，卻無法真正地解決問題。應用系統思考的觀點，可以讓我們在事件的表象之外，重新建構整個系統的模型，藉由正確的應對方式加強或改善眼前的狀態，而非在其它地方再製造出不同的問題。
何謂系統？系統的屬性並非來自元素個別的行為，而是來自元素之間的互動。系統中沒有任何一個元素可以單獨擁有系統的基本屬性與命定功能，就像沒有任何汽車零件可以單獨提供運輸服務，也沒有任何器官能在脫離人體之後繼續存活。系統是一個整體，分割之後便無效能。當系統遭到肢解，系統和其元素就會喪失其基本屬性與命定功能，即使再將這些遭肢解後的元素堆在一塊，也不能改變其遭肢解的事實，它也就不再是系統。

系統思考是一種以因果回饋環路及時間滯延為結構的動態整體思考。專案經理人透過系統思考對事件的前因後果及其影響做全面性考量，擴大經理人的思考空間與時間，把事件放在它所處的系統中思考。系統思考是彼得‧聖吉（Peter M. Senge）《第五項修練》的核心，它訓練我們擴大思考的時空範圍，以了解問題所處系統的全貌。系統思考讓我們學習看「結構」，而不是看事件。在面對事情時，應該是宏觀地掌握全局，而非只顧解決接踵而來的問題。前者能治「本」；後者偏向「頭痛醫頭、腳痛醫腳」，僅能治「標」。

專案經理人必須要具備系統思考的能力才能勇於創新，傳統的線性思考方式所強調的絕對事件因果關係，在複雜的專案環境中常常會不適用，因為在專案管理的過程中，很多事件的發生常是互為因果的，所以我們不可能用簡化的因果模型來管理我們的專案，而是要用動態模型才可能真正看到問題的癥結。專案經理人只有打破線性思考模型，才能真正地改善專案問題所帶來的困境。系統思考告訴我們：最顯而易見的解決方案雖然有效率（Efficiency），往往卻是沒有效能（Effectiveness）；這些頭痛醫頭腳痛醫腳，只能治標的特效藥對於病情只能有短期的改善，即時長期使用也無法治本，只會使病情更加惡化。